До 2005 года внутри организации «К.О.Н.Т.У.Р.» происходили события, оставившие значительный след в её истории. Некоторые решения Центральной Комиссии вызывали моральные и этические вопросы даже среди сотрудников. Архивные материалы того периода до сих пор вызывают споры относительно допустимых границ экспериментов над человеком.