Иркутск – многоконфессиональный город, где в мире и согласии живут представители разных вероисповеданий: христиане, католики, иудеи, буддисты, мусульмане.
В конце XIX и начале XX веков в общем потоке переселенцев, связанном с политикой развития Сибири и проведением крестьянских реформ, из европейской части России устремились и многие мусульмане. В основном это были татары и башкиры Поволжья и Приуралья из Казанской, Оренбургской, Уфимской и Пермской губерний. Количество жителей Иркутска и пригородов, исповедующих ислам, постоянно возрастало. Появилась необходимость в создании мечети — места, где по уставу веры верующие могли бы собираться для молитвы. В конце 2025 года исполняется 120 лет Иркутской соборной мечети — старейшей от Восточной Сибири до Тихого океана.

Основателями мечети считаются иркутские купцы Шафигуллины, учредители торгового дома «Братья Шафигуллины», специализировавшегося на торговле мехами.
Речь идет о Шайхулле и Загидулле Шафигуллиных из села Акзигитово Цивильского уезда (ныне Зеленодольский район Татарстана), которые во второй половине XIX столетия стали успешными сибирскими предпринимателями.
В 1897 году они пожертвовали под строительство мечети городскую усадьбу и постройки на Саломатовской улице (ныне ул. К. Либкнехта). Летом этого же года мечеть была открыта, и с минарета впервые в Иркутске прозвучал азан. При мечети была школа. Первым уездным имамом был утвержден мулла Гарых Баймуратов.

Небольшое деревянное здание не могло удовлетворить нужды мусульман Иркутска. Поэтому сразу же начался сбор средств на строительство каменного здания. К 1905 году строительство нового здания мечети было окончено, и Иркутск украсился выразительной архитектурной постройкой с высоким минаретом. Иркутская мечеть признавалась одной из лучших в России.
Корпус мечети создан из массивных, тщательно обработанных блоков природного камня, большая часть 28-метрового минарета — из дерева. В основу облика храма легли каменные мечети Среднего Поволжья, которые объединяют в себе влияние восточной и европейской архитектуры: строгая симметрия, развитая продольная ось, по которой расположены высокое крыльцо, входной объем с минаретом, основной зал, вмещающий около 200 верующих, и михраб (ниша в стене).
В деревянной же мечети после появления каменной разместилась школа: на деньги Шафигуллиных содержалось медресе, а также новометодная (то есть джадидская — основанная на идеологии исламского модернизма, противостоявшего мусульманам-консерваторам) школа для девочек.

С 1939 по 1946 годы мечеть была закрыта. Здесь разместили жилые помещения, затем склады и овощехранилище. В этот же период был разобран минарет. Существует ошибочное мнение, что мечеть не закрывалась в течение советского периода российской истории, а прекращала функционировать только во время Великой Отечественной войны.
Ближе к концу ХХ века мечеть полностью вернули мусульманской общине. Перед ней встала непростая задача восстановления наследия: здание за годы непрофильной эксплуатации сильно изменилось, да и пожар конца 1980-х годов нанес ему заметный ущерб. К 2004 году удалось подготовить проект масштабной реставрации.
К работам удалось приступить лишь в 2011 году, когда собрали нужную сумму. Фасад очистили, привели в порядок, заменили кровлю, из-под земли выкопали целый этаж. В 2012 году начались работы по воссозданию утраченного минарета — их завершили в течение одного лета. Новый минарет создан по подобию снесенного в советские годы, хотя незначительные изменения в облике конструкций при детальном сравнении с историческими фото все-таки заметны.
Иркутская соборная мечеть входит в список памятников культурного наследия федерального значения.